这款免费软件可将路径（KEGG、GenMAPP、BioCarta......）可视化。用户可以在路径中直接显示来自基因和蛋白质实验（如Affymetrix 的微阵列）的各种定量数据（颜色代表数值）。路径项目与实验数据之间的链接是通过基因或蛋白质名称及其登录号实现的。此外，用户还可以通过网络界面中收集的链接（直接链接）快速浏览基因/蛋白质。
本程序仅包含 GENOM 2005 软件的一小部分功能。
本程序仅包含 GENOM 2005 软件的一小部分功能。
- 定量数据叠加：直接渲染已建立的生物网络内的差异基因表达和蛋白质浓度（其中自定义梯度和颜色代表精确的数值）。
- 跨平台 ID 映射：利用标准基因符号、蛋白质名称或官方数据库登录号自动链接通路组件和实验数据集。
- 全面的数据库集成：通过连接到主要公共存储库的自动化网络界面即时同步和更新生物途径，包括KEGG、BioCarta和GenMAPP。
- 基于网络的注释智能：动态获取补充基因和蛋白质注释。通过集成的网络界面立即访问目标信息页面，无需手动填写网络搜索表格。
- 可扩展的学术报告：导出针对科学期刊、演示文稿和数字作品集进行优化的高分辨率、可供出版的矢量和光栅图。
表格视图
APP 会用不同颜色显示每个信号的数据，让你快速了解数据的全貌。
基因表达途径
该截图显示了一个已加载的路径，它与你已加载的数据直接结合在一起。
基因详细信息
在这张截图中，你可以直接通过链接获取有关查询的更多信息。与其他程序不同，您可以点击链接直接进入结果页面，而无需填写网页表格。
更新途径
从互联网上轻松更新路径，无需费时搜索。
Product Compatibility: Free Version vs. GENOM 2005 Suite
Advanced Pathway Painter 是一款专门的独立工具，源自我们的综合基因组分析套件。下面是一个直接比较，显示该工具如何适合您的研究范围。
| 特征/指标 | GSA 高级通路画家 (APP) | GSA GENOM 2005 高级套件 |
|---|---|---|
| 授权模式 | 100% 免费/免费软件版 | 一次性付费许可证（企业/学术） |
| 通路可视化 | 完全启用（KEGG、BioCarta、GenMAPP） | 完全启用 + 自定义途径架构师 |
| 数据映射 | 定量基因和蛋白质表达 | 全微阵列、下一代测序和质谱 |
| 3D聚类分析 | 基本 2D 渲染和映射 | 高级 3D 表达式图和散点图 |
| 数据库交叉链接 | 标准 Web 界面超链接 | 深度 SQL、PubMed 和 GeneOntology 集成 |
| 技术支援 | 社区论坛和标准电子邮件 | 优先 24/7 开发人员支持和 API 访问 |
常见问题 (FAQ)
► 什么是 Advanced Pathway Painter？它如何帮助我的研究？
它是一款专用的生物信息学软件，可以可视化生物途径并将其与定量实验数据集成。通过将数值映射到通路图上，您可以立即识别样品组中哪些生物过程上调或下调。
► 支持哪些实验数据集和平台？
该软件可处理任何标准定量数据集，包括微阵列转录本（例如 Affymetrix 阵列）、RNA-Seq 计数和目标蛋白质组学概况。只要您的数据包含已识别的基因或蛋白质名称或登录号，该工具就可以执行映射。
► 我需要为途径更新或数据库访问付费吗？
不会。GSA Advanced Pathway Painter 是一款免费软件应用程序。 KEGG、BioCarta 和 GenMAPP 的自动网络更新完全免费，可以直接从软件面板触发。
► 该软件与虚拟化环境完全兼容吗？
是的。该软件高度优化、轻量级，不需要庞大的外部数据库。它可以在所有现代 Windows 操作系统和 Windows Server 版本上本机运行。此外，Mac 和 Linux 研究人员可以使用 Parallels、Wine 或标准虚拟机等虚拟化层轻松部署它。