Advanced Pathway Painter
Visualisierung von Pathways (KEGG, GenMAPP..)
Programm zur Visualisierung von Pathways (KEGG, BioCarta, GenMAPP). Es besteht die M?glichkeit, quantitative Daten aus Gen- und Protein-Experimenten direkt mit den Pathways zu verbinden. Dabei werden die Werte in die Pathways eingezeichnet.
Der Advanced Pathway Painter ist ein Freeware-Programm zur Visualisierung von Pathways (KEGG, GenMAPP, BioCarta...). Es besteht die Möglichkeit, quantitative Daten aus Gen- bzw. Protein-Experimenten (zum Beispiel Microarrays von Affymetrix) direkt mit den angezeigten Pathways zu verbinden. Dabei werden die jeweiligen Werte in die Pathways eingezeichnet (Farben korrespondieren mit eingestellten Werten). Die Verknüpfung erfolgt über die Gen- oder Protein-Namen bzw. über die jeweilige Accession-Nummer. Darüber hinaus besteht die Möglichkeit einer umfangreichen Informationsgewinnung durch eine vorhandene Internetverlinkung zu den interessierenden Internetdatenbanken. Dieses Programm stellt einen kleinen Teil des Funktionsumfanges der Software GENOM 2005 dar und ist lizenzfrei.
Tabellenansicht
Dies sieht zunächst wie eine gewöhnliche Exceltabelle aus. Jedoch werden hier automatisch die Farben der Signalwerte angepasst. Dadurch erhält man einen schnellen Überblick über die einzelnen Werte.
Pathway - BioCarta
Dieser Bildschirmabzug zeigt einen geladenen Pathway mit eingefärbten Genen (Farben korrespondieren mit der Höhe der Signalwerte).
Web-Interface
In diesem Bild sehen Sie direkte Internetverweise zu weiteren Informationen Ihrer Suche. Im Gegensatz zu anderen Programmen müssen Sie keine Formulare der Internetseiten ausfüllen oder Schaltflächen anklicken. Die gewünschten Informationen werden automatisch abgerufen.
Pathways aktualisieren
Einfaches Aktualisieren der vorhanden Pathways über das Internet.
