Der Advanced Pathway Painter ist ein Freeware-Programm zur Visualisierung von Pathways (KEGG, GenMAPP, BioCarta...). Es besteht die Möglichkeit, quantitative Daten aus Gen- bzw. Protein-Experimenten (zum Beispiel Microarrays von Affymetrix) direkt mit den angezeigten Pathways zu verbinden. Dabei werden die jeweiligen Werte in die Pathways eingezeichnet (Farben korrespondieren mit eingestellten Werten). Die Verknüpfung erfolgt über die Gen- oder Protein-Namen bzw. über die jeweilige Accession-Nummer. Darüber hinaus besteht die Möglichkeit einer umfangreichen Informationsgewinnung durch eine vorhandene Internetverlinkung zu den interessierenden Internetdatenbanken. Dieses Programm stellt einen kleinen Teil des Funktionsumfanges der Software GENOM 2005 dar und ist lizenzfrei.

Tabellenansicht

Dies sieht zunächst wie eine gewöhnliche Exceltabelle aus. Jedoch werden hier automatisch die Farben der Signalwerte angepasst. Dadurch erhält man einen schnellen Überblick über die einzelnen Werte.
Gene Data Table
Advanced Pathway Painter - BioCarta Pathway

Pathway - BioCarta

Dieser Bildschirmabzug zeigt einen geladenen Pathway mit eingefärbten Genen (Farben korrespondieren mit der Höhe der Signalwerte).

Web-Interface

In diesem Bild sehen Sie direkte Internetverweise zu weiteren Informationen Ihrer Suche. Im Gegensatz zu anderen Programmen müssen Sie keine Formulare der Internetseiten ausfüllen oder Schaltflächen anklicken. Die gewünschten Informationen werden automatisch abgerufen.
Gene Browser
Pathway Update

Pathways aktualisieren

Einfaches Aktualisieren der vorhanden Pathways über das Internet.

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