GENOM 2005: 先进的微阵列分析软件
GENOM 2005 是一个功能丰富的综合生物信息学平台，专为微阵列和基于阵列的差异基因表达实验的高级分析而设计。这款用户友好的软件经过专门设计，支持高密度阵列（例如 Affymetrix 的阵列），弥合了原始数据处理和高影响力的生物学见解之间的差距。通过集成多方法分析流程、自动路径图谱、预测功能基因组学和直接文献交叉引用，GENOM 2005 加快了分子生物学家、遗传学家和临床研究人员的发现工作流程。
动态表达分析
通过专为快速数据审核而设计的可定制、高对比度颜色编码，立即可视化多信号阵列数据。每个转录本行都完全映射到其相应的官方基因符号和标准数据库登录号。
基因表达图
快速查看哪个数组数据具有最多的峰值。放大/缩小以轻松找到阵列上有趣的点。
交互式 3D 微阵列拓扑
在沉浸式 3D 空间视图中渲染探测强度。轻松并排比较多个阵列，以查明统计上显着的异常探针组。按生物功能或物理染色体位点动态对数据进行排序。
染色体作图坐标
根据转录本在染色体上的物理坐标分布，依次绘制和显示转录本谱，揭示区域遗传上调或下调。
时程表达轨迹
跟踪连续时间点或条件下的特定探针组动力学。线性趋势图在复杂的实验阶段分离出共同调控的基因组。
直接途径整合
立即将您加载的转录组图谱叠加到标准化生物通路图上。这种天然交联使您可以一目了然地观察全身代谢或信号传导调整。
精准途径架构师
利用集成的矢量图编辑器从头开始构建原始的定制分子通路，或快速编辑现有的公共网络以匹配您独特的实验室假设。
自动 BLAST 功能预测
未表征的序列和表达序列标签 (EST) 不再限制您的发现范围。直接通过平台向在线 BLAST 查询提交未注释的转录本或自定义 FASTA 序列，以预测新的基因功能和结构特性。
函数预测详情
有关函数预测的详细信息。
综合PubMed文献挖掘
直接在软件工作区中查询全球 PubMed 档案。根据过滤的基因或目标关键词提取并返回上下文相关的医学和科学文献。
MeSH 语义优化
利用集成的医学主题词 (MeSH) 层次结构来构建精确、高精度的查询字符串，以实现自动文献源。
动态基因相互作用网络
根据获取的 PubMed 摘要中的共现和科学相关性生成关系图，可视化复杂的基因间相互作用网络。
微阵列的基因功能
该算法在表格中显示数据，其中包含您之前筛选出的基因中的所有基因功能。可以对整个阵列执行此操作。
GeneOntology (GO) 核心图谱
使用结构化 GeneOntology 术语对过滤后的数据集进行分类和审查。可以跨交互式 GO 树分析探针集分布，以评估细胞成分、分子功能或整体生物过程。
探针信息
基因信息对话框。在这里，您可以从搜索的查询中获取更详细的信息，例如序列、描述等。
即时查询超链接
以零数据摩擦访问外部基因组存储库。只需单击探针卡内的任何参考链接即可启动准确的在线目标页面，而无需手动填写网络查找表格。
探针组的功能
基因功能的另一个 GeneOntology 图。
深入的计算机研究和数据库交叉链接
GENOM 2005 将外部数据库直接集成到其界面中，无需在 Web 浏览器和外部搜索表单之间手动切换。
矩阵层次聚类
以最少的配置执行复杂的聚类算法。该软件自动将相似的基因表达谱分组在一起，生成清晰的、解释性的热图和树状图。
交互式散点图
评估全局转录本差异，评估技术或生物复制均匀性，并使用动态多变量散点图跟踪比较表达偏差。