GENOM 2005
Анализ на микрочипове за масиви на Affymetrix
Богато на функции и удобно за потребителя приложение за анализ на експерименти с масиви (напр. от доставчика Affymetrix). То включва допълнителна информация за гените, множество методи за анализ, автоматично картографиране на пътищата с редактор, прогнозиране на функциите...
ДНК анализ на микрочипове
Genom 2005 представя данните в различни цветове за всеки сигнал. Получавате бърз преглед на данните. Във всеки ред се представя името на гена и номерът на присъединяване за всеки набор от сонди.
Графика на генната експресия
Това е диаграма с един масив. Тя показва по една лента за всеки набор от сонди.
3D изглед
Можете да покажете всеки сигнал в масива в 3D изглед. Когато го сравнявате с друг масив, можете лесно да откриете интересни набори от сонди. Можете също така да сортирате сигналите по генна функция или местоположение на гена.
Местоположение на хромозомите
Този изглед показва всички набори от сонди, подредени по местоположението им върху хромозомата.
Процес на генна експресия
Тази снимка на екрана показва графика, в която всеки набор от сонди е представен с линия. Тя показва регулирането на даден ген в посока нагоре/надолу в различни периоди от време.
Преглед на пътя
На тази снимка е показана заредена пътека, която се комбинира директно с данните от масива, които сте заредили.
Редактор на пътеки
С този интегриран редактор на карти можете лесно да създавате нови пътища или да редактирате съществуващи.
Предвиждане на функцията на гена
Често не разполагате с информация за даден набор от сонди, тъй като той е EST или не е бил анализиран преди. С този модул можете да получите нова информация от набори от сонди или потребителски последователности чрез търсене по BLAST (онлайн). След това ще бъдат показани възможните нови функции на гените.
Подробности за прогнозиране на функцията
Подробности за предсказването на функцията.
Изследвания на PubMED
PubMED е най-голямата база данни в света с медицински статии (поместена на уебсайта на Ncbi). Този модул търси в тази база данни и връща резултати, които са подходящи за въведения термин (или ген).
Изследвания MeSH
MeSH (Medical Subject Headings) предоставя подредени термини за подобряване на търсенето в PubMED, например.
Мрежа от гени
Връзката между гените, описани в резюметата от PubMED, е показана тук като диаграма на връзката.
Генни функции за микрочипове
Този алгоритъм представя данните в таблица с всички генни функции от гените, които предварително сте филтрирали, или може да бъде направен за целия масив.
GeneOntology за масив
Това показва функциите на гените в изглед, подобен на GeneOntology.
Информация за набора от сонди
Диалогов прозорец с информация за гена. Тук можете да получите по-подробна информация за търсената заявка, като последователност, описание и др.
Подробности за набора от сонди
На този екран можете да получите директен достъп до връзките за повече информация за вашето запитване. За разлика от други програми можете да щракнете върху връзка и да получите директен достъп до страницата с резултатите, без да попълвате уеб формуляри.
Функции за Probeset
Друга графика на GeneOntology за функциите на гена от гена.
Изследване в интернет
На този екран можете да видите директни връзки за повече информация за вашето запитване. За разлика от други програми можете да щракнете върху връзка и да стигнете директно до страницата с резултатите, без да попълвате уеб формуляри.
Изглед на клъстера
Този клъстер може да бъде направен лесно. Той показва най-равностойните стойности, събрани заедно в графика.
Диаграма на разсейване
Друг изглед от клъстерния алгоритъм.
