GENOM 2005: Avansert programvare for mikroarray-analyse
GENOM 2005 er en omfattende, funksjonsrik bioinformatikkplattform designet for avansert analyse av mikroarray- og arraybaserte differensielle genekspresjonseksperimenter. Spesielt konstruert for å støtte arrayer med høy tetthet - som de fra Affymetrix - denne brukervennlige programvaren bygger bro mellom rådatabehandling og biologisk innsikt med høy effekt. Ved å integrere multi-metode analytiske pipelines, automatisert banekartlegging, prediktiv funksjonell genomikk og direkte litteraturkryssreferanser, akselererer GENOM 2005 oppdagelsesarbeidsflyter for molekylærbiologer, genetikere og kliniske forskere.
Dynamisk uttrykksprofilering
Visualiser multi-signal array-data umiddelbart med tilpassbar fargekoding med høy kontrast designet for rask datarevisjon. Hver transkripsjonsrad er fullstendig kartlagt til dets tilsvarende offisielle gensymbol og standard databasetilgangsnummer.
Genuttrykksgraf
Se raskt hvilke matrisedata som har flest topper. Zoom inn/ut for enkelt å finne de interessante stedene på arrayet ditt.
Interaktiv 3D Microarray Topologi
Gjengi sondeintensiteter i en oppslukende 3D romlig visning. Sammenlign enkelt flere matriser side ved side for å finne statistisk signifikante avvikende probesett. Sorter data dynamisk etter biologisk funksjon eller fysisk kromosomalt sted.
Kromosomal kartleggingskoordinater
Kartlegg og vis transkripsjonsprofiler sekvensielt basert på deres fysiske koordinatfordeling på tvers av kromosomer, og avslører regionale genetiske opp- eller nedreguleringer.
Tidsforløpsuttrykksbaner
Spor spesifikk probesettkinetikk på tvers av sekvensielle tidspunkter eller forhold. Lineære trendgrafer isolerer samregulerte gengrupper på tvers av komplekse eksperimentelle faser.
Direkte Pathway-integrasjon
Overlegg dine lastede transkriptomiske profiler umiddelbart på standardiserte biologiske banekart. Denne innfødte kryssbindingen lar deg observere systemiske metabolske eller signaljusteringer med et øyeblikk.
Precision Pathway Arkitekt
Bruk den integrerte vektorkartredigereren til å konstruere originale, skreddersydde molekylære baner fra bunnen av, eller rediger raskt eksisterende offentlige nettverk for å matche dine unike laboratoriehypoteser.
Automatisert BLAST funksjonell prediksjon
Ukarakteriserte sekvenser og Expressed Sequence Tags (EST-er) begrenser ikke lenger oppdagelsesomfanget ditt. Send uannoterte transkripsjoner eller tilpassede FASTA-sekvenser til en online BLAST-forespørsel direkte gjennom plattformen for å forutsi nye genfunksjoner og strukturelle identiteter.
Funksjonsprediksjonsdetaljer
Detaljer om funksjonsprediksjonen.
Integrert PubMed Literature Mining
Spørr det globale PubMed-arkivet direkte i programvarearbeidsområdet. Trekk ut og returner kontekstuelt relevant medisinsk og vitenskapelig litteratur basert på filtrerte gener eller målsøkeord.
MeSH semantikkoptimalisering
Utnytt integrerte hierarkier for medisinske emneoverskrifter (MeSH) for å konstruere presise søkestrenger med høy nøyaktighet for automatisert litteraturinnhenting.
Dynamiske geninteraksjonsnettverk
Generer relasjonsdiagrammer basert på samtidig forekomst og vitenskapelige korrelasjoner i hentede PubMed-abstrakter, visualiser komplekse gen-til-gen interaktom-nettverk.
Genfunksjoner for Microarray
Denne algoritmen presenterer dataene i en tabell med alle genfunksjonene fra genene du tidligere filtrerte ut. This can be done for the whole array.
GeneOntology (GO) Kjernekartlegging
Kategoriser og gjennomgå filtrerte datasett ved å bruke strukturert GeneOntology-terminologi. Probesetfordelinger kan analyseres på tvers av interaktive GO-trær for å evaluere cellulære komponenter, molekylære funksjoner eller generelle biologiske prosesser.
Probeset informasjon
Geninformasjonsdialogen. Her får du mer detaljert informasjon fra søket som sekvens, beskrivelse og mer.
Instant Query Hyperlinking
Få tilgang til eksterne genomiske depoter med null datafriksjon. Bare klikk på en hvilken som helst referanselenke inne i et probeset-kort for å starte den eksakte online målsiden uten å fylle ut nettoppslagsskjemaer manuelt.
Funksjoner for Probeset
En annen GeneOntology-graf av genet fungerer fra genet.
Deep In-Silico Research & Database Cross-Linking
GENOM 2005 integrerer eksterne databaser direkte i grensesnittet, og eliminerer behovet for manuelt å veksle mellom nettlesere og eksterne søkeskjemaer.
Matrix hierarkisk klynging
Utfør komplekse klyngealgoritmer med minimal konfigurasjon. Programvaren grupperer automatisk lignende genuttrykksprofiler sammen, og genererer klare, tolkende varmekart og dendrogrammer.
Interaktive spredningsplott
Evaluer globale transkripsjonsvarians, vurder teknisk eller biologisk replikatenhet, og spor komparative uttrykksavvik ved hjelp av dynamiske, multivariable spredningsdiagrammer.