GENOM 2005
Ανάλυση μικροσυστοιχιών για συστοιχίες Affymetrix
Πλούσια σε χαρακτηριστικά και φιλική προς το χρήστη εφαρμογή για την ανάλυση πειραμάτων συστοιχιών (π.χ. από τον πάροχο Affymetrix). Περιλαμβάνει πρόσθετες πληροφορίες γονιδίων, πολλαπλές μεθόδους ανάλυσης, αυτόματη χαρτογράφηση μονοπατιών με επεξεργαστή, πρόβλεψη λειτουργίας...
Ανάλυση μικροσυστοιχιών DNA
Το Genom 2005 παρουσιάζει τα δεδομένα με διαφορετικά χρώματα για κάθε σήμα. Έχετε μια γρήγορη επισκόπηση των δεδομένων. Σε κάθε γραμμή παρουσιάζεται ένα όνομα γονιδίου και ένας αριθμός προσθήκης για κάθε ανιχνευτή.
Γράφημα γονιδιακής έκφρασης
Αυτό είναι ένα διάγραμμα με έναν πίνακα. Δείχνει μια μπάρα για κάθε σύνολο ανιχνευτών.
Προβολή 3D
Μπορείτε να εμφανίσετε κάθε σήμα στη συστοιχία σας σε τρισδιάστατη προβολή. Όταν το συγκρίνετε με μια άλλη συστοιχία, μπορείτε εύκολα να βρείτε ενδιαφέροντα σύνολα ανιχνευτών. Μπορείτε επίσης να ταξινομήσετε τα σήματα ανά γονιδιακή λειτουργία ή γονιδιακή θέση.
Χρωμόσωμα Τοποθεσία
Αυτή η προβολή εμφανίζει όλες τις σειρές ανιχνευτών με βάση τη θέση τους στο χρωμόσωμα.
Διαδικασία γονιδιακής έκφρασης
Αυτό το στιγμιότυπο οθόνης δείχνει ένα γράφημα όπου κάθε σύνολο ανιχνευτών αντιπροσωπεύεται από μια γραμμή. Δείχνει την ανοδική/καθοδική ρύθμιση ενός γονιδίου μεταξύ διαφορετικών χρόνων.
Προβολή διαδρομής
Αυτό το στιγμιότυπο οθόνης δείχνει ένα φορτωμένο μονοπάτι το οποίο συνδυάζεται άμεσα με τα δεδομένα της συστοιχίας που έχετε φορτώσει.
Συντάκτης διαδρομής
Με αυτόν τον ενσωματωμένο επεξεργαστή χαρτών, μπορείτε εύκολα να δημιουργήσετε νέες διαδρομές ή να επεξεργαστείτε μια υπάρχουσα.
Πρόβλεψη γονιδιακής λειτουργίας
Συχνά δεν έχετε καμία πληροφορία για ένα probeset επειδή είναι EST ή δεν έχει αναλυθεί στο παρελθόν. Με αυτήν την ενότητα μπορείτε να λάβετε νέες πληροφορίες από probesets ή προσαρμοσμένες αλληλουχίες μέσω μιας αναζήτησης BLAST (online). Στη συνέχεια θα εμφανιστούν πιθανές νέες λειτουργίες γονιδίων.
Λεπτομέρειες πρόβλεψης λειτουργίας
Λεπτομέρειες σχετικά με την πρόβλεψη της λειτουργίας.
PubMED Έρευνα
Το PubMED είναι η μεγαλύτερη βάση δεδομένων στον κόσμο με ιατρικά άρθρα (φιλοξενείται στον δικτυακό τόπο του Ncbi). Αυτή η ενότητα πραγματοποιεί αναζήτηση σε αυτή τη βάση δεδομένων και επιστρέφει σχετικά αποτελέσματα με τον εισαγόμενο όρο (ή γονίδιο).
Έρευνα MeSH
Το MeSH (Medical Subject Headings) παρέχει ταξινομημένους όρους για τη βελτίωση των αναζητήσεων στο PubMED, για παράδειγμα.
Δίκτυο γονιδίων
Οι σχέσεις των γονιδίων που περιγράφονται στις περιλήψεις από το PubMED παρουσιάζονται εδώ ως διάγραμμα σχέσεων.
Γονιδιακές λειτουργίες για Microarray
Αυτός ο αλγόριθμος παρουσιάζει τα δεδομένα σε έναν πίνακα με όλες τις γονιδιακές λειτουργίες από τα γονίδια που φιλτράρατε προηγουμένως ή μπορεί να γίνει για ολόκληρη τη συστοιχία.
GeneOntology για μια συστοιχία
Αυτό εμφανίζει τις λειτουργίες των γονιδίων σε μια προβολή που μοιάζει με την προβολή GeneOntology.
Πληροφορίες Probeset
Ο διάλογος πληροφοριών γονιδίων. Εδώ μπορείτε να λάβετε περισσότερες λεπτομερείς πληροφορίες από το ερώτημα που αναζητήσατε, όπως αλληλουχία, περιγραφή και άλλα.
Λεπτομέρειες δοκιμαστικού συνόλου
Σε αυτό το στιγμιότυπο οθόνης, μπορείτε να έχετε άμεση πρόσβαση στους συνδέσμους για περισσότερες πληροφορίες σχετικά με το ερώτημά σας. Σε αντίθεση με άλλα προγράμματα, μπορείτε να κάνετε κλικ σε έναν σύνδεσμο και να αποκτήσετε απευθείας πρόσβαση στη σελίδα αποτελεσμάτων χωρίς να συμπληρώσετε φόρμες ιστού.
Λειτουργίες για το Probeset
Ένα άλλο γράφημα GeneOntology των γονιδιακών λειτουργιών από το γονίδιο.
Έρευνα στο Διαδίκτυο
Σε αυτό το στιγμιότυπο οθόνης μπορείτε να δείτε άμεσους συνδέσμους για περισσότερες πληροφορίες σχετικά με το ερώτημά σας. Σε αντίθεση με άλλα προγράμματα, μπορείτε να κάνετε κλικ σε έναν σύνδεσμο και να μεταβείτε απευθείας στη σελίδα αποτελεσμάτων χωρίς να συμπληρώσετε φόρμες web.
Προβολή συστάδας
Αυτό το σύμπλεγμα μπορεί να γίνει εύκολα. Δείχνει τις πιο ίσες τιμές σε ζεύγη σε ένα γράφημα.
Διάγραμμα διασποράς
Μια άλλη άποψη από τον αλγόριθμο συστάδων.
