GENOM 2005: Software avanzado de análisis de microarrays
GENOM 2005 es una plataforma bioinformática completa y con numerosas funciones, diseñada para el análisis avanzado de experimentos de expresión génica diferencial basados en microarrays y matrices. Este software, de fácil manejo y especialmente diseñado para trabajar con matrices de alta densidad —como las de Affymetrix—, sirve de puente entre el procesamiento de datos brutos y los conocimientos biológicos de gran relevancia. Mediante la integración de flujos de trabajo analíticos multimétodo, el mapeo automatizado de vías biológicas, la genómica funcional predictiva y las referencias cruzadas directas a la bibliografía, GENOM 2005 agiliza los flujos de trabajo de investigación para biólogos moleculares, genetistas e investigadores clínicos.
Perfilado dinámico de expresiones
Visualiza al instante los datos de matrices multisignal gracias a un código de colores personalizable y de alto contraste, diseñado para una rápida revisión de los datos. Cada fila de transcripción está totalmente asociada a su símbolo génico oficial correspondiente y a su número de acceso estándar en la base de datos.
Gráfico de expresión génica
Comprueba rápidamente qué datos del array presentan más picos. Acerca o aleja la imagen para localizar fácilmente los puntos de interés en tu array.
Topología interactiva en 3D de microarrays
Visualiza las intensidades de las sondas en una vista espacial 3D inmersiva. Compara fácilmente varias matrices una al lado de otra para identificar conjuntos de sondas atípicos estadísticamente significativos. Ordena los datos de forma dinámica por función biológica o locus cromosómico físico.
Coordenadas de mapeo cromosómico
Mapea y muestra los perfiles de transcripción de forma secuencial en función de su distribución de coordenadas físicas a lo largo de los cromosomas, poniendo de manifiesto las regulaciones genéticas al alza o a la baja en determinadas regiones.
Trayectorias de expresión a lo largo del tiempo
Realiza un seguimiento de la cinética de conjuntos de sondas específicos a lo largo de distintos momentos o condiciones. Los gráficos de tendencia lineal permiten identificar grupos de genes co-regulados en fases experimentales complejas.
Integración de la vía directa
Superpón al instante tus perfiles transcriptómicos cargados sobre mapas estandarizados de vías biológicas. Esta vinculación nativa te permite observar de un solo vistazo los ajustes metabólicos o de señalización sistémicos.
Arquitecto de itinerarios de precisión
Utiliza el editor de mapas vectoriales integrado para crear desde cero vías moleculares originales y personalizadas, o para editar rápidamente redes públicas ya existentes y adaptarlas a las hipótesis específicas de tu laboratorio.
Predicción funcional BLAST automatizada
Las secuencias no caracterizadas y las etiquetas de secuencia expresada (EST) ya no limitan el alcance de su descubrimiento. Envíe transcripciones sin anotaciones o secuencias FASTA personalizadas a una consulta BLAST en línea directamente a través de la plataforma para predecir nuevas funciones genéticas e identidades estructurales.
Detalles de predicción de funciones
Detalles sobre la predicción de la función.
Minería de literatura PubMed integrada
Consulta el archivo global de PubMed directamente dentro del espacio de trabajo del software. Extraiga y devuelva literatura médica y científica contextualmente relevante basada en genes filtrados o palabras clave objetivo.
Optimización semántica MeSH
Aproveche las jerarquías integradas de encabezados de temas médicos (MeSH) para crear cadenas de consulta precisas y de alta precisión para el abastecimiento automatizado de literatura.
Redes dinámicas de interacción genética
Genere diagramas de relaciones basados en la coocurrencia y correlaciones científicas dentro de resúmenes de PubMed obtenidos, visualizando redes complejas de interactomas de gen a gen.
Funciones genéticas para microarrays.
Este algoritmo presenta los datos en una tabla con todas las funciones genéticas de los genes que usted filtró previamente. Esto se puede hacer para toda la matriz.
Mapeo central de GeneOntology (GO)
Clasifique y revise conjuntos de datos filtrados utilizando terminología estructurada de GeneOntology. Las distribuciones de conjuntos de sondas se pueden analizar a través de árboles GO interactivos para evaluar componentes celulares, funciones moleculares o procesos biológicos generales.
Información del conjunto de sondas
El diálogo de información genética. Aquí obtiene información más detallada de la consulta buscada, como secuencia, descripción y más.
Hipervínculos de consulta instantánea
Acceda a repositorios genómicos externos sin fricción de datos. Simplemente haga clic en cualquier enlace de referencia dentro de una tarjeta de conjunto de sondas para iniciar la página de destino en línea exacta sin tener que completar formularios de búsqueda web manualmente.
Funciones para Probeset
Otro gráfico de GeneOntology del gen funciona a partir del gen.
Investigación profunda in-silico y enlace cruzado de bases de datos
GENOM 2005 integra bases de datos externas directamente en su interfaz, eliminando la necesidad de alternar manualmente entre navegadores web y formularios de búsqueda externos.
Agrupación jerárquica matricial
Ejecute algoritmos de agrupación complejos con una configuración mínima. El software agrupa automáticamente perfiles de expresión genética similares, generando dendrogramas y mapas de calor interpretativos claros.
Diagramas de dispersión interactivos
Evalúe las variaciones globales de transcripción, evalúe la uniformidad de las réplicas técnicas o biológicas y realice un seguimiento de las desviaciones de expresión comparativas mediante gráficos de diagrama de dispersión dinámicos y multivariables.