GENOM 2005
Analiza mikromrež za matrike Affymetrix
Funkcijsko bogata in uporabniku prijazna aplikacija za analizo eksperimentov z matrikami (npr. ponudnika Affymetrix). Vključuje dodatne informacije o genih, več metod analize, samodejno kartiranje poti z urejevalnikom, napovedovanje funkcij...
Analiza DNK z mikromrežami
Genom 2005 prikazuje podatke v različnih barvah za vsak signal. Tako imate hiter pregled nad podatki. V vsaki vrstici sta predstavljena ime gena in pristopna številka za vsak niz sond.
Graf izražanja genov
To je diagram z enim poljem. Za vsako sondo je prikazana vrstica.
3D pogled
Vsak signal v matriki lahko prikažete v 3D-prikazu. Če ga primerjate z drugim poljem, lahko zlahka najdete zanimive sklope sond. Signale lahko razvrstite tudi po funkciji ali lokaciji gena.
Lokacija kromosoma
V tem pogledu so prikazani vsi sklopi sond po njihovi lokaciji na kromosomu.
Proces izražanja genov
Ta zaslonska slika prikazuje graf, v katerem je vsak niz sond predstavljen s črto. Prikazuje regulacijo gena navzgor/navzdol v različnih časovnih obdobjih.
Pogled na pot
Ta zaslonska slika prikazuje naloženo pot, ki je neposredno združena z naloženimi podatki o polju.
Urednik poti
S tem integriranim urejevalnikom zemljevidov lahko preprosto ustvarite nove poti ali urejate obstoječe.
Napovedovanje delovanja genov
Pogosto nimate nobenih informacij o sondi, ker je EST ali ker še ni bila analizirana. S tem modulom lahko prek iskanja BLAST (na spletu) pridobite nove informacije iz sondnih nizov ali zaporedij po meri. Nato bodo prikazane morebitne nove funkcije genov.
Podrobnosti o napovedovanju funkcij
Podrobnosti o napovedi funkcije.
Raziskave PubMED
PubMED je največja podatkovna zbirka na svetu z medicinskimi članki (gostuje na spletni strani Ncbi). Ta modul išče po tej zbirki podatkov in vrne ustrezne rezultate za vneseni izraz (ali gen).
Raziskave MeSH
MeSH (Medical Subject Headings) zagotavlja urejene izraze za izboljšanje iskanja v PubMED, na primer.
Mreža genov
Razmerja med geni, opisanimi v izvlečkih iz PubMED, so tukaj prikazana kot diagram razmerij.
Funkcije genov za mikromrežo
Ta algoritem predstavi podatke v tabeli z vsemi funkcijami genov iz genov, ki ste jih predhodno filtrirali, lahko pa se izvede tudi za celotno matriko.
GeneOntologija za matriko
To prikaže funkcije genov v pogledu, ki je podoben pogledu GeneOntology.
Informacije o naboru sond
Pogovorno okno z informacijami o genih. Tu dobite podrobnejše informacije o iskani poizvedbi, kot so zaporedje, opis in drugo.
Podrobnosti o naboru sond
Na tej zaslonski sliki lahko neposredno dostopate do povezav za več informacij o svoji poizvedbi. V nasprotju z drugimi programi lahko kliknete povezavo in neposredno dostopate do strani z rezultati brez izpolnjevanja spletnih obrazcev.
Funkcije za Probeset
Še en graf GeneOntology funkcij gena iz gena.
Internetne raziskave
Na tej zaslonski sliki so prikazane neposredne povezave za več informacij o poizvedbi. V nasprotju z drugimi programi lahko kliknete na povezavo in pridete neposredno na stran z rezultati, ne da bi morali izpolnjevati spletne obrazce.
Pogled na grozd
Ta grozd je mogoče preprosto izdelati. Prikazuje najbolj enake vrednosti, ki so združene v paru v grafu.
Diagram razpršitve
Še en pogled na algoritem grozdenja.
