GENOM 2005: Phân tích microarray cho các mảng Affymetrix
Tính năng ứng dụng giàu có và thân thiện với người dùng để phân tích các thử nghiệm mảng (ví dụ: từ nhà cung cấp Affymetrix). Nó bao gồm thông tin gen bổ sung, nhiều phương pháp phân tích, ánh xạ đường dẫn tự động với trình soạn thảo, dự đoán chức năng ...
Phân tích DNA microarray
Genom 2005 trình bày dữ liệu bằng các màu khác nhau cho mỗi tín hiệu. Bạn có một cái nhìn tổng quan nhanh chóng về dữ liệu. Một tên gen và một số gia nhập cho mỗi đầu dò được trình bày trong mỗi hàng.
Biểu đồ biểu hiện gen
Đây là một sơ đồ với một mảng. Nó hiển thị một thanh cho mỗi đầu dò.
Chế độ xem 3D
Bạn có thể hiển thị từng tín hiệu trên mảng của bạn trong chế độ xem 3D. Khi so sánh nó với một mảng khác, bạn có thể dễ dàng tìm thấy các đầu dò thú vị. Bạn cũng có thể sắp xếp các tín hiệu theo chức năng gen hoặc vị trí gen.
Vị trí nhiễm sắc thể
Chế độ xem này hiển thị tất cả các đơn đặt hàng đầu dò theo vị trí của chúng trên nhiễm sắc thể.
Quá trình biểu hiện gen
Ảnh chụp màn hình này hiển thị một biểu đồ trong đó mọi đầu dò được biểu diễn bằng một dòng. Nó cho thấy sự điều chỉnh lên/xuống của một gen giữa các thời điểm khác nhau.
Chế độ xem con đường
Ảnh chụp màn hình này cho thấy một con đường được tải trực tiếp kết hợp với dữ liệu mảng bạn đã tải.
Biên tập viên Pathway
Với trình chỉnh sửa bản đồ tích hợp này, bạn có thể dễ dàng tạo các đường dẫn mới hoặc chỉnh sửa một đường dẫn hiện có.
Dự đoán chức năng gen
Thường thì bạn không có thông tin về một đầu dò vì đó là EST hoặc nó chưa được phân tích trước đây. Với mô -đun này, bạn có thể nhận được thông tin mới từ các đầu dò hoặc trình tự tùy chỉnh qua tìm kiếm vụ nổ (trực tuyến). Các chức năng gen mới có thể sau đó sẽ được hiển thị.
Chi tiết dự đoán chức năng
Chi tiết về dự đoán chức năng.
Nghiên cứu PubMed
PubMed là cơ sở dữ liệu lớn nhất thế giới với các bài báo y tế (được lưu trữ trên trang web NCBI). Mô -đun này tìm kiếm cơ sở dữ liệu và trả về các kết quả có liên quan cho thời hạn đã nhập (hoặc gen).
Nghiên cứu lưới
Lưới (tiêu đề chủ đề y tế) cung cấp các thuật ngữ được đặt hàng để cải thiện các tìm kiếm PubMed chẳng hạn.
Mạng gen
Mối quan hệ của các gen được mô tả trong tóm tắt từ PubMed được hiển thị ở đây dưới dạng sơ đồ mối quan hệ.
Chức năng gen cho microarray
Thuật toán này trình bày dữ liệu trong một bảng với tất cả các chức năng gen từ các gen bạn đã lọc trước đây hoặc có thể được thực hiện cho toàn bộ mảng.
Geneontology cho một mảng
Điều này hiển thị các chức năng gen trong một generyology như quan điểm.
Thông tin thăm dò
Hộp thoại thông tin gen. Ở đây bạn nhận được thêm thông tin chi tiết từ truy vấn được tìm kiếm như trình tự, mô tả và nhiều hơn nữa.
Chi tiết thăm dò
Trong ảnh chụp màn hình này, bạn có thể truy cập trực tiếp các liên kết để biết thêm thông tin về truy vấn của bạn. Không giống như trong các chương trình khác, bạn có thể nhấp vào liên kết và truy cập trực tiếp trang kết quả mà không cần điền vào các biểu mẫu web.
Chức năng cho thăm dò
Một biểu đồ gen khác của các chức năng gen từ gen.
Nghiên cứu Internet
Trong ảnh chụp màn hình này, bạn có thể thấy các liên kết trực tiếp để biết thêm thông tin về truy vấn của bạn. Không giống như trong các chương trình khác, bạn có thể nhấp vào liên kết và truy cập trực tiếp vào trang kết quả mà không cần điền vào các biểu mẫu web.
Quan điểm cụm
Cụm này có thể được thực hiện dễ dàng. Nó hiển thị các giá trị bằng nhau nhất được ghép với nhau trong một biểu đồ.
Biểu đồ phân tán
Một quan điểm khác từ thuật toán cụm.