GENOM 2005
Analiză microarray pentru array-uri Affymetrix
Aplicație bogată în caracteristici și ușor de utilizat pentru analizarea experimentelor de matrice (de exemplu, de la furnizorul Affymetrix). Aceasta include informații suplimentare despre gene, metode de analiză multiple, cartografierea automată a căilor cu un editor, predicția funcției...
Analiză ADN Microarray
Genom 2005 prezintă datele în culori diferite pentru fiecare semnal. Aveți o prezentare generală rapidă a datelor. În fiecare rând este prezentat un nume de genă și un număr de acces pentru fiecare set de sonde.
Graficul expresiei genice
Aceasta este o diagramă cu o matrice. Aceasta prezintă o bară pentru fiecare set de sonde.
Vedere 3D
Puteți afișa fiecare semnal de pe matricea dvs. într-o vizualizare 3D. Atunci când îl comparați cu un alt array, puteți găsi cu ușurință seturi de sonde interesante. De asemenea, puteți sorta semnalele în funcție de funcția genei sau de localizarea genei.
Localizarea cromozomului
Această vizualizare afișează toate seturile de sonde ordonate în funcție de locația lor pe cromozom.
Procesul de expresie genetică
Această captură de ecran prezintă un grafic în care fiecare set de sonde este reprezentat de o linie. Acesta arată reglarea ascendentă/ descendentă a unei gene între diferite perioade de timp.
Calea de vizualizare
Această captură de ecran arată o cale încărcată care este combinată direct cu datele matricei pe care le-ați încărcat.
Editor de traseu
Cu acest editor de hărți integrat, puteți crea cu ușurință căi noi sau puteți edita una existentă.
Predicția funcției genelor
Adesea nu aveți informații despre un set de sonde deoarece este un EST sau nu a fost analizat anterior. Cu ajutorul acestui modul puteți obține informații noi de la seturi de sonde sau secvențe personalizate printr-o căutare BLAST (online). Vor fi apoi afișate posibile funcții genetice noi.
Detalii privind predicția funcției
Detalii despre predicția funcției.
PubMED Cercetare
PubMED este cea mai mare bază de date din lume cu articole medicale (găzduită pe site-ul Ncbi). Acest modul caută în această bază de date și returnează rezultatele relevante pentru termenul (sau gena) introdus.
Cercetare MeSH
MeSH (Medical Subject Headings) oferă termeni ordonați pentru a îmbunătăți căutările PubMED, de exemplu.
Rețea de gene
Relațiile dintre genele descrise în rezumatele din PubMED sunt prezentate aici sub forma unei diagrame de relații.
Funcții genetice pentru Microarray
Acest algoritm prezintă datele într-un tabel cu toate funcțiile genelor din genele pe care le-ați filtrat anterior sau poate fi realizat pentru întreaga matrice.
GeneOntology pentru un aranjament
Aceasta afișează funcțiile genelor într-o vizualizare asemănătoare GeneOntology.
Informații Probeset
Dialogul cu informații despre gene. Aici obțineți informații mai detaliate despre interogarea căutată, cum ar fi secvența, descrierea și altele.
Probeset Detalii
În această captură de ecran, puteți accesa direct linkurile pentru mai multe informații despre interogarea dvs. Spre deosebire de alte programe, puteți să faceți clic pe un link și să accesați direct pagina cu rezultate fără a completa formulare web.
Funcții pentru Probeset
Un alt grafic GeneOntology al funcțiilor genei din genă.
Cercetare pe internet
În această captură de ecran puteți vedea linkuri directe pentru mai multe informații despre interogarea dvs. Spre deosebire de alte programe, puteți să faceți clic pe un link și să ajungeți direct la pagina cu rezultate fără a completa formulare web.
Vedere cluster
Acest cluster poate fi realizat cu ușurință. Acesta arată cele mai egale valori împerecheate împreună într-un grafic.
Scatterplot
O altă vedere a algoritmului cluster.
