GENOM 2005: برنامج تحليل ميكروأري متقدم
GENOM 2005 عبارة عن منصة معلوماتية حيوية شاملة وغنية بالميزات مصممة للتحليل المتقدم للمصفوفات الدقيقة وتجارب التعبير الجيني التفاضلي القائمة على المصفوفة. تم تصميم هذا البرنامج سهل الاستخدام خصيصًا لدعم المصفوفات عالية الكثافة - مثل تلك الموجودة في Affymetrix - وهو يسد الفجوة بين معالجة البيانات الأولية والرؤى البيولوجية عالية التأثير. ومن خلال دمج خطوط الأنابيب التحليلية متعددة الأساليب، ورسم خرائط المسارات الآلية، وعلم الجينوم الوظيفي التنبؤي، والإحالة المرجعية المباشرة للأدبيات، يعمل GENOM 2005 على تسريع سير عمل الاكتشاف لعلماء الأحياء الجزيئية، وعلماء الوراثة، والباحثين السريريين.
ملفات تعريف التعبير الديناميكي
تصور بيانات مجموعة الإشارات المتعددة على الفور باستخدام ترميز الألوان عالي التباين القابل للتخصيص والمصمم لتدقيق البيانات بسرعة. يتم تعيين كل صف نص بشكل كامل لرمز الجين الرسمي المقابل له ورقم الوصول القياسي لقاعدة البيانات.
الرسم البياني للتعبير الجيني
تعرف بسرعة على بيانات المصفوفة التي تحتوي على أكبر عدد من القمم. قم بالتكبير/التصغير للعثور بسهولة على المواقع المثيرة للاهتمام في المصفوفة الخاصة بك.
طوبولوجيا ميكروأري تفاعلية ثلاثية الأبعاد
تقديم شدة التحقيق في عرض مكاني ثلاثي الأبعاد غامرة. قم بمقارنة صفائف متعددة جنبًا إلى جنب دون عناء لتحديد المجسات الخارجية ذات الأهمية الإحصائية. فرز البيانات ديناميكيًا حسب الوظيفة البيولوجية أو موضع الكروموسومات الفيزيائي.
إحداثيات رسم الخرائط الكروموسومية
قم بتعيين ملفات تعريف النسخ وعرضها بشكل تسلسلي بناءً على توزيع الإحداثيات المادية عبر الكروموسومات، مما يكشف عن اللوائح الجينية الإقليمية الأعلى أو الأسفل.
مسارات التعبير عن الدورة الزمنية
تتبع حركية مجموعة التحقيق المحددة عبر نقاط زمنية أو ظروف متسلسلة. تعزل الرسوم البيانية الاتجاهية الخطية مجموعات الجينات المنظمة عبر المراحل التجريبية المعقدة.
تكامل المسار المباشر
قم على الفور بتركيب ملفات التعريف النصية المحملة على خرائط المسار البيولوجي الموحدة. يسمح لك هذا الارتباط المتقاطع الأصلي بمراقبة تعديلات التمثيل الغذائي أو الإشارات النظامية في لمحة.
مهندس المسار الدقيق
استخدم محرر خرائط المتجهات المتكامل لإنشاء مسارات جزيئية أصلية مخصصة من البداية، أو قم بتحرير الشبكات العامة الحالية بسرعة لتتوافق مع فرضياتك المعملية الفريدة.
التنبؤ الوظيفي الآلي للانفجار
لم تعد التسلسلات غير المميزة وعلامات التسلسل المعبر عنها (ESTs) تحد من نطاق اكتشافك. قم بإرسال النصوص غير المشروحة أو تسلسلات FASTA المخصصة إلى استعلام BLAST عبر الإنترنت مباشرةً من خلال النظام الأساسي للتنبؤ بوظائف الجينات الجديدة والهويات الهيكلية.
تفاصيل التنبؤ بالوظيفة
تفاصيل حول التنبؤ بالوظيفة.
التعدين الأدبي المتكامل في PubMed
الاستعلام عن أرشيف PubMed العالمي مباشرة داخل مساحة عمل البرنامج. قم باستخراج الأدبيات الطبية والعلمية ذات الصلة بالسياق وإعادتها بناءً على الجينات التي تمت تصفيتها أو الكلمات الرئيسية المستهدفة.
تحسين دلالات MeSH
استفد من التسلسلات الهرمية المتكاملة لعناوين الموضوعات الطبية (MeSH) لإنشاء سلاسل استعلام دقيقة وعالية الدقة لمصادر الأدبيات الآلية.
شبكات التفاعل الجيني الديناميكي
قم بإنشاء مخططات للعلاقات بناءً على التواجد المشترك والعلاقات العلمية ضمن ملخصات PubMed التي تم جلبها، وتصور الشبكات التفاعلية المعقدة من جين إلى جين.
وظائف الجينات للميكروأري
تعرض هذه الخوارزمية البيانات في جدول يحتوي على جميع وظائف الجينات من الجينات التي قمت بتصفيتها مسبقًا. يمكن القيام بذلك للمصفوفة بأكملها.
علم الجينات (GO) رسم الخرائط الأساسية
تصنيف ومراجعة مجموعات البيانات التي تمت تصفيتها باستخدام مصطلحات GeneOntology المنظمة. يمكن تحليل توزيعات Probeset عبر أشجار GO التفاعلية لتقييم المكونات الخلوية أو الوظائف الجزيئية أو العمليات البيولوجية الشاملة.
معلومات بروبيست
حوار المعلومات الجينية هنا تحصل على معلومات أكثر تفصيلاً من الاستعلام الذي تم البحث عنه مثل التسلسل والوصف والمزيد.
الارتباط التشعبي للاستعلام الفوري
يمكنك الوصول إلى مستودعات الجينوم الخارجية دون احتكاك بالبيانات. ما عليك سوى النقر فوق أي رابط مرجعي داخل بطاقة التحقيق لتشغيل الصفحة المستهدفة المحددة عبر الإنترنت دون ملء نماذج البحث على الويب يدويًا.
وظائف Probeset
رسم بياني آخر لعلم الجينات يعمل من الجين.
البحث العميق في السيليكو والربط المتبادل لقاعدة البيانات
يقوم GENOM 2005 بدمج قواعد البيانات الخارجية مباشرة في واجهته، مما يلغي الحاجة إلى التبديل يدويًا بين متصفحات الويب ونماذج البحث الخارجية.
مصفوفة التجميع الهرمي
تنفيذ خوارزميات التجميع المعقدة بأقل قدر من التكوين. يقوم البرنامج تلقائيًا بتجميع ملفات تعريف التعبير الجيني المتشابهة معًا، مما يؤدي إلى إنشاء خرائط حرارية وتفسيرات واضحة وتفسيرية.
مخططات التشتت التفاعلية
تقييم تباينات النص العالمية، وتقييم التوحيد التقني أو البيولوجي، وتتبع انحرافات التعبير المقارن باستخدام الرسوم البيانية الديناميكية متعددة المتغيرات.