GENOM 2005: ניתוח מיקרו -מערך למערכי Affymetrix
תכונות יישום עשיר וידידותי למשתמש לניתוח חפצי מערך (למשל מ- Affymetrix של ספק). זה כולל מידע נוסף על גנים, שיטות ניתוח מרובות, מיפוי מסלול אוטומטי עם עורך, חיזוי פונקציה ...
ניתוח DNA של מיקרו -מערך
Genom 2005 מציג את הנתונים בצבעים שונים עבור כל אות. יש לך סקירה מהירה של הנתונים. שם כל שורה מוצגים שם גנים ומספר הצטרפות עבור כל בדיקה.
גרף ביטוי גנים
זוהי תרשים עם מערך אחד. זה מראה סרגל לכל בדיקה.
תצוגת תלת מימד
אתה יכול להציג כל אות במערך שלך בתצוגת תלת מימד. כשאתה משווה אותו למערך אחר, אתה יכול בקלות למצוא בדיקות מעניינות. אתה יכול גם למיין את האותות לפי תפקוד גנים או מיקום גנים.
מיקום כרומוזום
תצוגה זו מציגה את כל ההזמנות של Probesets לפי מיקומם בכרומוזום.
תהליך ביטוי גנים
צילום מסך זה מציג גרף בו כל בדיקה מיוצגת על ידי שורה. זה מראה את הוויסות למעלה/למטה של גן בין זמן שונה.
נוף מסלול
צילום מסך זה מציג מסלול טעון המשולב ישירות עם נתוני המערך שהטענתם.
עורך נתיב
בעזרת עורך מפות משולב זה, באפשרותך ליצור בקלות מסלולי נתיבים חדשים או לערוך מסלול קיים.
חיזוי תפקודי גנים
לעתים קרובות אין לך מידע על בדיקה מכיוון שזה EST או שהוא לא נותח בעבר. בעזרת מודול זה תוכלו לקבל מידע חדש מ- Probesets או רצפים מותאמים אישית על פני חיפוש פיצוץ (מקוון). לאחר מכן יוצגו פונקציות גנים חדשות אפשריות.
פרטי חיזוי פונקציה
פרטים על חיזוי הפונקציה.
מחקר PubMed
PubMed הוא המאגר הגדול ביותר בעולם עם מאמרים רפואיים (מתארח באתר NCBI). מודול זה מחפש מסד נתונים ומחזיר תוצאות רלוונטיות למונח הזן (או לגן).
מחקר רשת
MESH (כותרות נושא רפואי) מספקת מונחים מסודרים לשיפור חיפושים ב- PubMed למשל.
רשת גנים
הקשר של הגנים המתוארים בתקצירים מ- PubMed מוצגים כאן כתרשים יחסים.
פונקציות גנים למיקרו -מערך
אלגוריתם זה מציג את הנתונים בטבלה עם כל פונקציות הגנים מהגנים שסיננתם בעבר, או שניתן לבצע אותם עבור כל המערך.
גנונטולוגיה למערך
זה מציג את פונקציות הגן בגנונטולוגיה כמו תצוגה.
מידע על בדיקה
תיבת הדו -שיח למידע על גנים. כאן אתה מקבל מידע מפורט יותר מהשאילתה שחיפשו כמו רצף, תיאור ועוד.
פרטי בדיקה
במסך מסך זה, באפשרותך לגשת ישירות לקישורים למידע נוסף על השאילתה שלך. שלא כמו בתוכנות אחרות תוכלו ללחוץ על קישור ולגשת ישירות לדף התוצאה מבלי למלא טפסי אינטרנט.
פונקציות ל- Probeset
גרף נוסף של גנונטולוגיה של הגן מתפקד מהגן.
מחקר באינטרנט
במסך מסך זה תוכלו לראות קישורים ישירים למידע נוסף על השאילתה שלכם. שלא כמו בתוכנות אחרות תוכלו ללחוץ על קישור ולהגיע ישירות לדף התוצאה מבלי למלא טפסי אינטרנט.
תצוגת אשכול
ניתן ליצור אשכול זה בקלות. זה מציג את הערכים השווים ביותר המשויכים יחד בתרשים.
פיזור
תצוגה נוספת מאלגוריתם האשכול.