GENOM 2005
Microarray elemzés Affymetrix tömbökhöz
Funkciógazdag és felhasználóbarát alkalmazás tömbkísérletek elemzésére (pl. az Affymetrix szolgáltatótól). Tartalmaz további géninformációkat, többféle elemzési módszert, automatikus útvonaltérképezést szerkesztővel, funkció-előrejelzést...
Microarray DNS-elemzés
A Genom 2005 az egyes jelek esetében különböző színekkel jeleníti meg az adatokat. Gyors áttekintést kap az adatokról. Minden egyes sorban megjelenik a gén neve és az egyes szondakészletek csatlakozási száma.
Génexpressziós grafikon
Ez a diagram egy tömböt tartalmaz. Minden egyes szondakészlethez egy sávot mutat.
3D nézet
A tömb minden jelét 3D nézetben jelenítheti meg. Ha összehasonlítja egy másik tömbtel, könnyen megtalálhatja az érdekes szondakészleteket. A jeleket génfunkció vagy gén helye szerint is rendezheti.
Kromoszóma elhelyezkedése
Ez a nézet az összes szondakészletet a kromoszómán való elhelyezkedésük szerint rendezve jeleníti meg.
Génexpressziós folyamat
Ez a képernyőkép egy grafikont mutat, ahol minden szondakészletet egy vonal ábrázol. Egy gén felfelé/lefelé szabályozását mutatja különböző időpontok között.
Útvonal nézet
Ez a képernyőkép egy betöltött útvonalat mutat, amely közvetlenül a betöltött tömbadatokkal van kombinálva.
Útvonal szerkesztő
Ezzel az integrált térképszerkesztővel könnyen létrehozhat új útvonalakat vagy szerkeszthet meglévő útvonalakat.
Gén funkció előrejelzés
Gyakran nem rendelkezik információval egy szondakészletről, mert az egy EST, vagy mert még nem elemezték korábban. Ezzel a modullal BLAST keresésen keresztül (online) új információkat kaphat a probesetekről vagy egyéni szekvenciákról. Ezután megjelennek a lehetséges új génfunkciók.
Funkció előrejelzés részletei
A funkció előrejelzésének részletei.
PubMED kutatás
A PubMED a világ legnagyobb orvosi cikkeket tartalmazó adatbázisa (az Ncbi honlapján található). Ez a modul ebben az adatbázisban keres, és a megadott kifejezéshez (vagy génhez) releváns eredményeket ad vissza.
MeSH kutatás
A MeSH (Medical Subject Headings) rendezett kifejezéseket biztosít a PubMED keresések javításához, például.
Génhálózat
A PubMED összefoglalóiban leírt gének kapcsolatát itt kapcsolati diagram formájában mutatjuk be.
Génfunkciók a Microarray számára
Ez az algoritmus az adatokat egy táblázatban mutatja be az összes génfüggvényt az előzőleg szűrt génekből, vagy a teljes tömbre is elvégezhető.
GeneOntológia egy tömbhöz
Ez megjeleníti a génfunkciókat egy geontológiában, például a nézetben.
Probalált információk
A géninformációs párbeszédpanel. Itt további részleteket kap a keresést a kereséstől, például szekvenciáról, leírásról és még sok másról.
A ProbeSet részletei
Ezen a képernyőképen közvetlenül elérheti a lekérdezéssel kapcsolatos további információkat tartalmazó linkeket. Más programokkal ellentétben egy linkre kattintva közvetlenül elérheti az eredményoldalt, webes űrlapok kitöltése nélkül.
Funkciók a Probeset számára
Egy másik GeneOntology grafikon a gén funkcióiról a génből.
Internetes kutatás
Ezen a képernyőképen közvetlen linkeket láthat a lekérdezéssel kapcsolatos további információkhoz. Más programokkal ellentétben egy linkre kattintva közvetlenül az eredményoldalra juthat, webes űrlapok kitöltése nélkül.
Klaszter nézet
Ez a klaszter könnyen elkészíthető. A legegyenletesebb értékeket párosítva mutatja egy grafikonon.
Scatterplot
Egy másik nézet a klaszter algoritmusból.
