GENOM 2005: Affymetrix 어레이를 위한 마이크로어레이 분석
배열 실험을 분석하기 위한 풍부하고 사용자 친화적인 애플리케이션(예: 제공업체 Affymetrix)의 기능. 여기에는 추가 유전자 정보, 여러 분석 방법, 편집기를 사용한 자동 경로 매핑, 기능 예측... 등이 포함됩니다.
마이크로어레이 DNA 분석
Genom 2005는 각 신호마다 다른 색상으로 데이터를 표시합니다. 데이터에 대한 간략한 개요를 볼 수 있습니다. 각 프로브셋에 대한 유전자 이름과 접근 번호가 각 행에 표시됩니다.
유전자 발현 그래프
이것은 하나의 배열이 있는 다이어그램입니다. 각 프로브 세트에 대한 막대를 표시합니다.
3D 보기
어레이의 각 신호를 3D 보기로 표시할 수 있습니다. 다른 어레이와 비교할 때 흥미로운 프로브셋을 쉽게 찾을 수 있습니다. 유전자 기능이나 유전자 위치별로 신호를 정렬할 수도 있습니다.
염색체 위치
이 보기는 모든 프로브셋 순서를 염색체 위치별로 표시합니다.
유전자 발현 과정
이 스크린샷은 모든 프로브셋이 선으로 표시된 그래프를 보여줍니다. 시간대별로 유전자의 업/다운 조절을 보여줍니다.
경로 보기
이 스크린샷은 로드한 배열 데이터와 직접 결합된 로드 경로를 보여줍니다.
경로 편집기
이 통합 지도 편집기를 사용하면 새 경로를 쉽게 만들거나 기존 경로를 편집할 수 있습니다.
유전자 기능 예측
프로브셋이 EST이거나 이전에 분석된 적이 없기 때문에 정보가 없는 경우가 종종 있습니다. 이 모듈을 사용하면 BLAST 검색(온라인)을 통해 프로브셋 또는 사용자 지정 시퀀스에서 새로운 정보를 얻을 수 있습니다. 그러면 가능한 새로운 유전자 기능이 표시됩니다.
기능 예측 세부 정보
함수 예측에 대한 자세한 내용입니다.
PubMED 연구
PubMED는 의학 논문이 포함된 세계 최대 규모의 데이터베이스입니다(Ncbi 웹사이트에서 호스팅). 이 모듈은 해당 데이터베이스를 검색하여 입력한 용어(또는 유전자)와 관련된 결과를 반환합니다.
MeSH 연구
예를 들어 MeSH(의학 주제 제목)는 PubMED 검색을 개선하기 위해 정렬된 용어를 제공합니다.
유전자 네트워크
PubMED의 초록에 설명된 유전자의 관계를 관계 다이어그램으로 표시했습니다.
마이크로어레이의 유전자 기능
이 알고리즘은 이전에 필터링한 유전자의 모든 유전자 기능이 포함된 테이블에 데이터를 표시하거나 전체 배열에 대해 수행할 수 있습니다.
배열을 위한 유전자 온톨로지
유전자 기능을 유전자 온톨로지 유사 보기에 표시합니다.
프로브셋 정보
유전자 정보 대화상자. 여기에서 서열, 설명 등과 같은 검색된 쿼리의 자세한 정보를 확인할 수 있습니다.
프로브셋 세부 정보
이 스크린샷에서는 쿼리에 대한 자세한 정보를 볼 수 있는 링크에 직접 액세스할 수 있습니다. 다른 프로그램과 달리 링크를 클릭하면 웹 양식을 작성하지 않고도 결과 페이지에 바로 액세스할 수 있습니다.
프로브셋의 기능
유전자의 유전자 기능에 대한 또 다른 유전자 온톨로지 그래프입니다.
인터넷 조사
이 스크린샷에서는 쿼리에 대한 자세한 정보를 확인할 수 있는 직접 링크를 볼 수 있습니다. 다른 프로그램과 달리 링크를 클릭하면 웹 양식을 작성하지 않고도 결과 페이지로 바로 이동할 수 있습니다.
클러스터 보기
이 클러스터는 쉽게 만들 수 있습니다. 가장 동일한 값을 한 쌍으로 묶어 그래프로 표시합니다.
분산형 차트
클러스터 알고리즘의 또 다른 보기입니다.
