GENOM 2005: 고급 마이크로어레이 분석 소프트웨어
GENOM 2005는 마이크로어레이 및 어레이 기반 차등 유전자 발현 실험의 고급 분석을 위해 설계된 포괄적이고 기능이 풍부한 생물정보학 플랫폼입니다. Affymetrix와 같은 고밀도 어레이를 지원하도록 특별히 설계된 이 사용자 친화적인 소프트웨어는 원시 데이터 처리와 영향력이 큰 생물학적 통찰력 사이의 격차를 해소합니다. 다중 방법 분석 파이프라인, 자동화된 경로 매핑, 예측 기능 유전체학 및 직접적인 문헌 상호 참조를 통합함으로써 GENOM 2005는 분자 생물학자, 유전학자 및 임상 연구자를 위한 발견 작업 흐름을 가속화합니다.
동적 표현 프로파일링
신속한 데이터 감사를 위해 설계된 사용자 정의 가능한 고대비 색상 코딩을 통해 다중 신호 배열 데이터를 즉시 시각화합니다. 각 성적표 행은 해당 공식 유전자 기호 및 표준 데이터베이스 접근 번호에 완전히 매핑됩니다.
유전자 발현 그래프
어떤 어레이 데이터에 가장 많은 피크가 있는지 빠르게 확인하세요. 확대/축소하여 어레이에서 흥미로운 지점을 쉽게 찾을 수 있습니다.
대화형 3D 마이크로어레이 토폴로지
몰입형 3D 공간 보기에서 프로브 강도를 렌더링합니다. 여러 어레이를 나란히 비교하여 통계적으로 중요한 이상치 프로브 세트를 찾아냅니다. 생물학적 기능이나 물리적 염색체 위치를 기준으로 데이터를 동적으로 정렬합니다.
염색체 매핑 좌표
염색체 전체의 물리적 좌표 분포를 기반으로 전사 프로필을 순차적으로 매핑하고 표시하여 지역적 유전적 상향 또는 하향 조절을 노출합니다.
시간 경과 표현 궤적
순차적인 시점 또는 조건에 걸쳐 특정 프로브 세트 동역학을 추적합니다. 선형 추세 그래프는 복잡한 실험 단계에서 공동 조절되는 유전자 그룹을 분리합니다.
직접 경로 통합
로드된 전사체 프로필을 표준화된 생물학적 경로 지도에 즉시 오버레이합니다. 이 기본 교차 연결을 통해 전신 대사 또는 신호 조정을 한 눈에 관찰할 수 있습니다.
정밀 진로 설계자
통합된 벡터 맵 편집기를 활용하여 독창적인 맞춤형 분자 경로를 처음부터 구성하거나 기존 공용 네트워크를 신속하게 편집하여 고유한 실험실 가설과 일치시키세요.
자동화된 BLAST 기능 예측
특성화되지 않은 시퀀스와 EST(Expeded Sequence Tags)는 더 이상 검색 범위를 제한하지 않습니다. 주석이 없는 전사본이나 맞춤형 FASTA 서열을 플랫폼을 통해 온라인 BLAST 쿼리에 직접 제출하여 새로운 유전자 기능과 구조적 정체성을 예측할 수 있습니다.
함수 예측 세부사항
함수 예측에 대한 세부정보입니다.
통합 PubMed 문헌 마이닝
소프트웨어 작업 공간 내에서 직접 글로벌 PubMed 아카이브를 쿼리하세요. 필터링된 유전자 또는 타겟 키워드를 기반으로 상황에 맞는 의학 및 과학 문헌을 추출하고 반환합니다.
MeSH 의미론 최적화
통합된 MeSH(Medical Subject Headings) 계층을 활용하여 자동화된 문헌 소싱을 위한 정확하고 정확도가 높은 쿼리 문자열을 구성합니다.
동적 유전자 상호작용 네트워크
가져온 PubMed 초록 내 동시발생 및 과학적 상관관계를 기반으로 관계 다이어그램을 생성하고 복잡한 유전자 간 상호작용 네트워크를 시각화합니다.
마이크로어레이의 유전자 기능
이 알고리즘은 이전에 필터링한 유전자의 모든 유전자 기능이 포함된 데이터를 표로 표시합니다. 이는 전체 배열에 대해 수행될 수 있습니다.
GeneOntology(GO) 코어 매핑
구조화된 GeneOntology 용어를 사용하여 필터링된 데이터 세트를 분류하고 검토합니다. 프로브 세트 분포는 대화형 GO 트리를 통해 분석되어 세포 구성 요소, 분자 기능 또는 전반적인 생물학적 과정을 평가할 수 있습니다.
프로브셋 정보
유전자 정보 대화 상자. 여기에서는 시퀀스, 설명 등과 같은 검색된 쿼리에 대한 자세한 정보를 얻을 수 있습니다.
인스턴트 쿼리 하이퍼링크
데이터 마찰 없이 외부 게놈 저장소에 액세스하세요. 웹 조회 양식을 수동으로 작성하지 않고도 프로브 세트 카드 내부의 참조 링크를 클릭하기만 하면 정확한 온라인 대상 페이지를 시작할 수 있습니다.
Probeset의 기능
유전자의 또 다른 GeneOntology 그래프는 유전자의 기능입니다.
Deep In-Silico 연구 및 데이터베이스 교차 연결
GENOM 2005는 외부 데이터베이스를 인터페이스에 직접 통합하므로 웹 브라우저와 외부 검색 양식 사이를 수동으로 전환할 필요가 없습니다.
행렬 계층적 클러스터링
최소한의 구성으로 복잡한 클러스터링 알고리즘을 실행합니다. 이 소프트웨어는 유사한 유전자 발현 프로필을 자동으로 그룹화하여 명확하고 해석 가능한 히트맵과 덴드로그램을 생성합니다.
대화형 산점도
동적 다변수 산점도 그래프를 사용하여 전체 전사 차이를 평가하고, 기술적 또는 생물학적 복제 균일성을 평가하고, 비교 발현 편차를 추적합니다.