GENOM 2005: Logiciel avancé d'analyse de puces à ADN
GENOM 2005 est une plate-forme bioinformatique complète et riche en fonctionnalités, conçue pour l'analyse avancée des expériences d'expression génique différentielle basées sur des puces à ADN et des puces à ADN. Spécialement conçu pour prendre en charge les matrices haute densité, telles que celles d'Affymetrix, ce logiciel convivial comble le fossé entre le traitement des données brutes et les informations biologiques à fort impact. En intégrant des pipelines analytiques multi-méthodes, une cartographie automatisée des voies, une génomique fonctionnelle prédictive et des références croisées directes avec la littérature, GENOM 2005 accélère les flux de travail de découverte pour les biologistes moléculaires, les généticiens et les chercheurs cliniques.
Profilage d'expression dynamique
Visualisez instantanément les données d'un réseau multi-signaux grâce à un codage couleur personnalisable et à contraste élevé conçu pour un audit rapide des données. Chaque ligne de transcription est entièrement mappée à son symbole de gène officiel correspondant et à son numéro d'accès à la base de données standard.
Graphique d'expression génétique
Découvrez rapidement quelles données du tableau présentent le plus de pics. Effectuez un zoom avant/arrière pour trouver facilement les endroits intéressants sur votre baie.
Topologie interactive des puces à ADN 3D
Restituez les intensités des sondes dans une vue spatiale 3D immersive. Comparez sans effort plusieurs tableaux côte à côte pour identifier les ensembles de sondes aberrants statistiquement significatifs. Triez les données de manière dynamique par fonction biologique ou par locus chromosomique physique.
Coordonnées de cartographie chromosomique
Cartographiez et affichez les profils de transcription de manière séquentielle en fonction de leur distribution de coordonnées physiques sur les chromosomes, exposant ainsi les régulations génétiques régionales positives ou négatives.
Trajectoires d’expression temporelle
Suivez la cinétique d’un ensemble de sondes spécifiques à travers des points ou des conditions séquentiels. Les graphiques de tendance linéaires isolent les groupes de gènes co-régulés au cours de phases expérimentales complexes.
Intégration directe du parcours
Superposez instantanément vos profils transcriptomiques chargés sur des cartes de voies biologiques standardisées. Cette réticulation native vous permet d’observer en un coup d’œil les ajustements systémiques métaboliques ou de signalisation.
Architecte de parcours de précision
Utilisez l'éditeur de cartes vectorielles intégré pour construire des voies moléculaires originales et sur mesure à partir de zéro, ou modifiez rapidement les réseaux publics existants pour correspondre à vos hypothèses de laboratoire uniques.
Prédiction fonctionnelle automatisée de BLAST
Les séquences non caractérisées et les balises de séquence exprimées (EST) ne limitent plus votre portée de découverte. Soumettez des transcriptions non annotées ou des séquences FASTA personnalisées à une requête BLAST en ligne directement via la plateforme pour prédire de nouvelles fonctions génétiques et identités structurelles.
Détails de la prédiction de fonction
Détails sur la prédiction de la fonction.
Exploration intégrée de la littérature PubMed
Interrogez l’archive globale PubMed directement dans l’espace de travail du logiciel. Extrayez et renvoyez de la littérature médicale et scientifique contextuellement pertinente en fonction de gènes filtrés ou de mots-clés cibles.
Optimisation de la sémantique MeSH
Tirez parti des hiérarchies MeSH (Medical Subject Headings) intégrées pour créer des chaînes de requête précises et de haute précision pour la recherche automatisée de littérature.
Réseaux d'interaction génétique dynamique
Générez des diagrammes de relations basés sur la cooccurrence et les corrélations scientifiques dans les résumés PubMed récupérés, en visualisant des réseaux complexes d'interactome de gène à gène.
Fonctions génétiques pour Microarray
Cet algorithme présente les données dans un tableau avec toutes les fonctions des gènes que vous avez précédemment filtrés. Cela peut être fait pour l'ensemble du tableau.
Cartographie de base de GeneOntology (GO)
Catégorisez et examinez les ensembles de données filtrés à l’aide de la terminologie structurée de GeneOntology. Les distributions de sondes peuvent être analysées dans des arbres GO interactifs pour évaluer les composants cellulaires, les fonctions moléculaires ou les processus biologiques globaux.
Informations sur la sonde
La boîte de dialogue d'informations sur les gènes. Ici, vous obtenez des informations plus détaillées sur la requête recherchée, telles que la séquence, la description, etc.
Liens hypertexte de requête instantanée
Accédez à des référentiels génomiques externes sans friction de données. Cliquez simplement sur n'importe quel lien de référence dans une carte de sonde pour lancer la page cible en ligne exacte sans remplir manuellement les formulaires de recherche Web.
Fonctions pour Probeset
Un autre graphique GeneOntology des fonctions du gène à partir du gène.
Recherche approfondie In-Silico et interconnexion de bases de données
GENOM 2005 intègre des bases de données externes directement dans son interface, éliminant ainsi le besoin de basculer manuellement entre les navigateurs Web et les formulaires de recherche externes.
Clustering hiérarchique matriciel
Exécutez des algorithmes de clustering complexes avec une configuration minimale. Le logiciel regroupe automatiquement des profils d’expression génique similaires, générant des cartes thermiques et des dendrogrammes clairs et interprétatifs.
Nuages de points interactifs
Évaluez les variances globales des transcriptions, évaluez l’uniformité des répliques techniques ou biologiques et suivez les écarts d’expression comparatifs à l’aide de graphiques de nuages de points dynamiques à plusieurs variables.