GENOM 2005
Affymetrix matricu mikroshēmu analīze
Funkcijām bagāta un lietotājam draudzīga lietojumprogramma masīvu eksperimentu analīzei (piem., Affymetrix piegādātāja). Tā ietver papildu informāciju par gēniem, vairākas analīzes metodes, automātisku ceļu kartēšanu ar redaktoru, funkciju prognozēšanu...
Mikroshēmu DNS analīze
Genom 2005 datus katram signālam attēlo dažādās krāsās. Jums ir ātrs pārskats par datiem. Katrā rindā ir norādīts gēna nosaukums un pievienošanās numurs katrai zondes kopai.
Gēnu ekspresijas grafiks
Šī ir diagramma ar vienu masīvu. Tajā parādīta josla katram zondes kopumam.
3D skats
Katru masīva signālu varat attēlot 3D skatā. Salīdzinot to ar citu masīvu, varat viegli atrast interesantus zondes kopumus. Signālus var arī sakārtot pēc gēna funkcijas vai gēna atrašanās vietas.
Hromosomu atrašanās vieta
Šajā skatā tiek parādīti visi zondesetu sakārtojumi pēc to atrašanās vietas hromosomā.
Gēnu ekspresijas process
Šajā ekrāna attēlā redzams grafiks, kurā katrs zondes kopums ir attēlots ar līniju. Tas parāda gēna regulāciju augšup/ lejup starp dažādiem laikiem.
Ceļa skats
Šajā ekrāna attēlā redzams ielādēts ceļš, kas ir tieši apvienots ar ielādētajiem masīva datiem.
Ceļa redaktors
Izmantojot šo integrēto karšu redaktoru, varat viegli izveidot jaunus ceļus vai rediģēt esošos.
Gēnu funkciju prognozēšana
Bieži vien jums nav informācijas par zondes kopu, jo tā ir EST vai arī tā iepriekš nav analizēta. Izmantojot šo moduli, jūs varat iegūt jaunu informāciju par zondesetiem vai pielāgotām sekvencēm, izmantojot BLAST meklēšanu (tiešsaistē). Pēc tam tiks parādītas iespējamās jaunās gēnu funkcijas.
Funkciju prognozēšanas informācija
Sīkāka informācija par funkcijas prognozēšanu.
PubMED pētījumi
PubMED ir lielākā medicīnisko rakstu datubāze pasaulē (izvietota Ncbi tīmekļa vietnē). Šis modulis veic meklēšanu šajā datubāzē un atgriež atbilstošus rezultātus ievadītajam terminam (vai gēnam).
MeSH pētījumi
MeSH (Medical Subject Headings) nodrošina sakārtotus terminus, lai uzlabotu PubMED meklēšanu, piemēram.
Gēnu tīkls
PubMED kopsavilkumos aprakstīto gēnu attiecības šeit ir parādītas kā attiecību diagramma.
Gēnu funkcijas mikrotīklam
Šis algoritms datus parāda tabulā ar visām gēnu funkcijām no iepriekš filtrētajiem gēniem, vai arī to var veikt visam masīvam.
GeneOntology masīvam
Tas parāda gēnu funkcijas GeneOntology līdzīgā skatā.
Probeset informācija
Dialoglodziņš ar informāciju par gēnu. Šeit jūs varat iegūt sīkāku informāciju par meklēto vaicājumu, piemēram, secību, aprakstu un citu informāciju.
Zondes komplekta detaļas
Šajā ekrāna attēlā varat tieši piekļūt saitēm, lai iegūtu plašāku informāciju par savu vaicājumu. Atšķirībā no citām programmām jūs varat noklikšķināt uz saites un tieši piekļūt rezultātu lapai, neaizpildot tīmekļa veidlapas.
Probeset funkcijas
Cits gēna funkciju grafiks no gēna GeneOntology.
Interneta izpēte
Šajā ekrānšāviņš redzamas tiešās saites, lai iegūtu plašāku informāciju par jūsu vaicājumu. Atšķirībā no citām programmām jūs varat noklikšķināt uz saites un nokļūt tieši uz rezultātu lapu, neaizpildot tīmekļa veidlapas.
Klastera skats
Šo klasteri var viegli izveidot. Tas parāda visvienādākās vērtības, kas grafikā ir sasaistītas pa pāriem.
Izkliedes diagramma
Cits skats no klastera algoritma.
