GENOM 2005: Software avanzato di analisi di microarray
GENOM 2005 è una piattaforma bioinformatica completa e ricca di funzionalità progettata per l'analisi avanzata di esperimenti di espressione genica differenziale basati su microarray. Progettato appositamente per supportare array ad alta densità, come quelli di Affymetrix, questo software intuitivo colma il divario tra l'elaborazione dei dati grezzi e le informazioni biologiche ad alto impatto. Integrando pipeline analitiche multimetodo, mappatura automatizzata dei percorsi, genomica funzionale predittiva e riferimenti incrociati diretti alla letteratura, GENOM 2005 accelera i flussi di lavoro di scoperta per biologi molecolari, genetisti e ricercatori clinici.
Profilatura dinamica delle espressioni
Visualizza istantaneamente i dati dell'array multi-segnale con codifica a colori personalizzabile e ad alto contrasto progettata per un rapido controllo dei dati. Ogni riga della trascrizione è completamente mappata al simbolo del gene ufficiale corrispondente e al numero di accesso al database standard.
Grafico dell'espressione genica
Visualizza rapidamente quali dati dell'array presentano il maggior numero di picchi. Ingrandisci/riduci per trovare facilmente i punti interessanti sul tuo array.
Topologia microarray 3D interattiva
Rendering delle intensità della sonda in una vista spaziale 3D coinvolgente. Confronta facilmente più array affiancati per individuare set di sonde anomali statisticamente significativi. Ordina i dati in modo dinamico per funzione biologica o locus cromosomico fisico.
Coordinate della mappatura cromosomica
Mappa e visualizza i profili di trascrizione in sequenza in base alla loro distribuzione delle coordinate fisiche sui cromosomi, esponendo le regolazioni genetiche positive o negative regionali.
Traiettorie di espressione nel corso del tempo
Traccia la cinetica specifica del set di sonde attraverso punti temporali o condizioni sequenziali. I grafici di tendenza lineari isolano gruppi di geni co-regolati attraverso fasi sperimentali complesse.
Integrazione del percorso diretto
Sovrapponi istantaneamente i tuoi profili trascrittomici caricati su mappe di percorsi biologici standardizzati. Questa reticolazione nativa consente di osservare a colpo d'occhio gli aggiustamenti metabolici o di segnalazione sistemici.
Architetto di percorsi di precisione
Utilizza l'editor di mappe vettoriali integrato per costruire da zero percorsi molecolari originali e personalizzati o modificare rapidamente le reti pubbliche esistenti per adattarle alle tue ipotesi di laboratorio uniche.
Previsione funzionale BLAST automatizzata
Le sequenze non caratterizzate e gli Expressed Sequence Tag (EST) non limitano più l'ambito del rilevamento. Invia trascrizioni senza annotazioni o sequenze FASTA personalizzate a una query BLAST online direttamente tramite la piattaforma per prevedere nuove funzioni genetiche e identità strutturali.
Dettagli sulla previsione della funzione
Dettagli sulla previsione della funzione.
Estrazione integrata della letteratura PubMed
Interroga l'archivio globale PubMed direttamente all'interno dell'area di lavoro del software. Estrarre e restituire letteratura medica e scientifica contestualmente rilevante in base a geni filtrati o parole chiave target.
Ottimizzazione della semantica MeSH
Sfrutta le gerarchie integrate di intestazioni di soggetti medici (MeSH) per costruire stringhe di query precise e ad alta precisione per l'approvvigionamento automatizzato della letteratura.
Reti di interazione genetica dinamica
Genera diagrammi di relazione basati su co-occorrenze e correlazioni scientifiche all'interno di abstract PubMed recuperati, visualizzando complesse reti di interattomi da gene a gene.
Funzioni geniche per Microarray
Questo algoritmo presenta i dati in una tabella con tutte le funzioni genetiche dei geni precedentemente filtrati. Questo può essere fatto per l'intero array.
Mappatura del nucleo di GeneOntology (GO).
Categorizza e rivedi i set di dati filtrati utilizzando la terminologia strutturata di GeneOntology. Le distribuzioni di sondeset possono essere analizzate attraverso alberi GO interattivi per valutare componenti cellulari, funzioni molecolari o processi biologici complessivi.
Informazioni sulla sonda
La finestra di dialogo delle informazioni sui geni. Qui ottieni informazioni più dettagliate dalla query cercata come sequenza, descrizione e altro.
Collegamento ipertestuale di query istantanee
Accedi a repository genomici esterni senza attrito dei dati. È sufficiente fare clic su qualsiasi collegamento di riferimento all'interno di una scheda Probeset per avviare l'esatta pagina di destinazione online senza compilare manualmente i moduli di ricerca Web.
Funzioni per Probeset
Un altro grafico GeneOntology delle funzioni del gene dal gene.
Ricerca in silico profondo e collegamento incrociato di database
GENOM 2005 integra database esterni direttamente nella sua interfaccia, eliminando la necessità di alternare manualmente tra browser web e moduli di ricerca esterni.
Clustering gerarchico di matrici
Esegui algoritmi di clustering complessi con una configurazione minima. Il software raggruppa automaticamente profili di espressione genetica simili, generando mappe di calore e dendrogrammi chiari e interpretativi.
Grafici a dispersione interattivi
Valuta le varianze globali della trascrizione, valuta l'uniformità tecnica o biologica della replica e monitora le deviazioni comparative dell'espressione utilizzando grafici a dispersione dinamici e multivariabili.